《黄帝阴符经》以其词语诡奇、精悍玄妙而晦涩难懂。难懂就需要领悟，研习道家典籍特别注重这一点。《阴符经》内涵深刻、微妙通达，“非深于道者不能作”（见朱熹《阴符经考异》），所以研习者更要深钻。《阴符经》末尾有“阴阳相推，而变化顺矣”（阴阳相互排开推移，则各种变化演化顺其自然）、“阴阳相胜之术，昭昭乎近乎象矣”（阴阳相生相克的方式方法，清晰明显的样子接近于各种事物景象了）之句，因此其中含有丰富的阴阳之道。那阴阳之道在《阴符经》文句中的体现有哪些呢？我们可以参照经文来看。“天之道”即含有阴阳之道，宇宙即阴阳的结合。“天有五贼”（自然界有“命、物、时、功、神”为万物所共有的属性），按张果本“五贼”即“五德”，“贼”为阴，“德”为阳。“天性，人也；人心，机也。”（自然的属性造就成人，思想意识是人的中枢。）人体为阴，人心为阳。“天发杀机”、“地发杀机”、“人发杀机”（天、地、人具有生与死的主导枢纽），世人多认为文句中杀气太重，实则误解。杀机中暗含生机，“杀机”为阴，生机为阳，故而“天生天杀，道之理也”（自然出生、自然灭亡是大道的纹理显现），生杀之义尽显，对立统一尽在其中。“三盗既宜，三才既安”（天地人三者相互据有、利用达到融洽，这三种材就相安无事），“盗”为阴，“才”为阳。“人知其神而神，不知其神所以神”（人们知道它们神奇而感到神奇，却认识不到神奇的原因），鬼神莫测，阴阳出没。“君子得之固躬，小人得之轻命”（君子获取“盗机”巩固躯体，小人获取“盗机”轻视性命），君子与小人阴阳对立。“心生于物，死于物，机在目”（意念意识产生于物体物质，又湮灭在其上，其枢纽在于眼睛），“物”为阴，“心”为阳，验证了唯物论。“生者，死之根；死者，生之根。恩生于害，害于恩”（生是死的本源，死也是生的本源。恩泽产生于受损害，又被恩泽损害），“生”与“死”、“恩”与“害”含有阴阳的对立与相互转化。“愚人以天地文理圣，我以时物文理哲。”（质朴之人以通晓天文地理为知识，通达之人以领悟时下文章和物理为智慧。）“圣”与“哲”为“阴阳相胜之术”。按“阴为阳之体，阳为阴之用”的原则，结合经文来看，其中的一些文句实为阴中暗含阳，这是《阴符经》的一大特点。不领悟到这一点，就容易曲解《阴符经》。
